Connect with us

Bio-ingénieur

Les cellules T peuvent lancer des attaques contre de nombreuses cibles du SRAS-CoV-2, même sur une nouvelle variante de virus

Une nouvelle recherche sur le LJI donne un aperçu détaillé des sites vulnérables du nouveau coronavirus – au-delà du domaine de liaison au récepteurCrédit: NIAID LA JOLLA – A…

Published

on

Une nouvelle recherche LJI donne un aperçu détaillé des sites vulnérables sur le nouveau coronavirus – au-delà du domaine de liaison au récepteur

LA JOLLA – Une nouvelle étude menée par des scientifiques de l'Institut La Jolla d'immunologie (LJI) suggère que les cellules T tentent de combattre le SRAS-CoV-2 en ciblant un large éventail de sites sur le virus – au-delà des sites clés sur la protéine de pointe du virus . En attaquant le virus sous de nombreux angles, le corps dispose des outils pour reconnaître potentiellement différentes variantes du SRAS-CoV-2.

La nouvelle recherche, publiée le 27 janvier 2021 dans Cell Report Medicine, est l'analyse la plus détaillée à ce jour des protéines sur le SRAS-CoV-2 stimulant les réponses les plus fortes des cellules T CD4 + «auxiliaires» du système immunitaire et des CD8 + T «tueurs» cellules.

«Nous savons maintenant quelles parties du virus sont reconnues par le système immunitaire», déclare le professeur LJI Alessandro Sette, Dr Biol. Sci., Qui a codirigé la nouvelle étude avec l'instructeur LJI Alba Grifoni, Ph.D.

Sette et Grifoni ont mené des recherches sur les réponses immunitaires au virus depuis le début de la pandémie. Leurs études précédentes, codirigées par des membres du groupe de travail LJI sur le coronavirus, montrent que les gens peuvent avoir un large éventail de réponses au virus – certaines personnes ont de fortes réponses immunitaires et réussissent bien. D'autres ont des réponses immunitaires disjointes et sont plus susceptibles de se retrouver à l'hôpital.

Alors que les vaccins COVID-19 atteignent plus de personnes, les scientifiques de LJI surveillent comment différentes personnes construisent une immunité contre le SRAS-CoV-2. Ils étudient également comment les cellules T pourraient combattre différentes variantes du SRAS-CoV-2. Ces travaux tirent parti de l'expertise du laboratoire dans la prédiction et l'étude des réponses des lymphocytes T à des virus tels que la dengue et le Zika.

«C'est encore plus important avec le COVID-19 car il s'agit d'une pandémie mondiale, nous devons donc tenir compte des réponses immunitaires dans différentes populations», déclare Grifoni.

Le système immunitaire est très flexible. En réembrouillant le matériel génétique, il peut produire des cellules T qui répondent à une vaste gamme de cibles, ou épitopes, sur un agent pathogène. Certaines réponses des lymphocytes T seront plus fortes contre certains épitopes que d'autres. Les chercheurs appellent les cibles qui provoquent une forte réponse des cellules immunitaires «immunodominantes».

Pour la nouvelle étude, les chercheurs ont examiné les cellules T de 100 personnes qui s'étaient rétablies d'une infection par le SRAS-CoV-2. Ils ont ensuite examiné de près la séquence génétique du virus pour séparer les épitopes potentiels des épitopes que ces cellules T reconnaîtraient réellement.

Leur analyse a révélé que toutes les parties du virus n'induisent pas la même forte réponse immunitaire chez tout le monde. En fait, les cellules T peuvent reconnaître des dizaines d'épitopes sur le SRAS-CoV-2, et ces sites immunodominants changent également d'une personne à l'autre. En moyenne, chaque participant à l'étude avait la capacité de reconnaître environ 17 épitopes de cellules T CD8 + et 19 épitopes de cellules T CD4 +.

Cette large réponse du système immunitaire sert à plusieurs fins. La nouvelle étude montre que, bien que le système immunitaire monte souvent une forte réponse contre un site particulier sur la protéine «pic» du virus appelée domaine de liaison au récepteur, cette région n'est en fait pas aussi efficace pour induire une forte réponse des cellules T auxiliaires CD4 +.

Sans une forte réponse des lymphocytes T CD4 +, cependant, les personnes peuvent être lentes à mettre en place le type de réponse immunitaire neutralisante qui élimine rapidement le virus. Heureusement, la large réponse immunitaire est pratique et la plupart des gens ont des cellules immunitaires capables de reconnaître des sites autres que le domaine de liaison au récepteur.

Parmi les nombreux épitopes qu'ils ont découverts, les chercheurs ont identifié plusieurs épitopes supplémentaires sur la protéine de pointe du SRAS-CoV-2. Grifoni dit que c'est une bonne nouvelle. En ciblant de nombreux sites vulnérables sur la protéine de pointe, le système immunitaire serait toujours capable de combattre l'infection, même si certains sites du virus changent en raison de mutations.

«La réponse immunitaire est suffisamment large pour compenser cela», dit Grifoni.

Depuis l'annonce de la variante britannique à propagation rapide du SARS-CoV-2 (appelée SARS-CoV-2 VUI 202012/01), les chercheurs ont comparé les sites mutés de ce virus aux épitopes qu'ils ont trouvés. Sette note que les mutations décrites dans le variant britannique pour la protéine de pointe n'affectent que 8% des épitopes reconnus par les cellules T CD4 + dans cette étude, tandis que 92% des réponses sont conservées.

Sette a souligné que la nouvelle étude est le résultat de mois de longues heures et de collaboration internationale entre les laboratoires du LJI; l'Université de Californie, San Diego; et chercheur à l’université australienne de Murdoch. «C'était une énorme quantité de travail, et nous avons pu le faire très rapidement grâce à nos collaborations», dit-il.

###

L'étude intitulée «Analyse complète de l'immunodominance et de l'immunoprevalence des cellules T des épitopes du SRAS-CoV-2 dans les cas de COVID-19» a été soutenue par l'Institut national des allergies et des maladies infectieuses des National Institutes of Health (AI42742, 75N9301900065 et 75N93019C00001), le Instituts nationaux de la santé (U01 CA260541-01, AI135078 et AI036214); UCSD T32s (AI007036 et AI007384), la Fondation Jonathan et Mary Tu et l'Université de Gênes, Italie.

Les autres auteurs de l'étude comprennent le premier auteur Alison Tarke, John Sidney, Conner Kidd, Jennifer M. Dan, Sydney I. Ramirez, Esther Dawen Yu, Jose Mateus, Ricardo da Silva Antunes, Erin Moore, Paul Rubiro, Nils Methot, Elizabeth Phillips, Simon Mallal, April Frazier, Stephen A. Rawlings, Jason A. Greenbaum, Bjoern Peters, Davey M. Smith, Shane Crotty et Daniela Weiskopf.

DOI: 10.1016 / j.xcrm / 2021/100202

À propos de l'Institut La Jolla d'immunologie

L'Institut La Jolla d'immunologie se consacre à la compréhension des subtilités et de la puissance du système immunitaire afin que nous puissions appliquer ces connaissances pour promouvoir la santé humaine et prévenir un large éventail de maladies. Depuis sa création en 1988 en tant qu'organisme de recherche indépendant à but non lucratif, l'Institut a fait de nombreux progrès pour atteindre son objectif: vivre sans maladie.

Source: https://bioengineer.org/t-cells-can-mount-attacks-against-many-sars-cov-2-targets-even-on-new-virus-variant/

Bio-ingénieur

La technique de l'armée améliore les opérations sur le champ de bataille des robots

Crédit: (Photo illustration / U.S.Army) ADELPHI, Maryland – Des chercheurs de l'armée ont développé une technique qui permet aux robots de rester résilients…

Published

on

Crédit: (Illustration photo / armée américaine)

ADELPHI, Maryland – Des chercheurs de l'armée ont développé une technique qui permet aux robots de rester résilients face à des pertes de communication intermittentes sur le champ de bataille.

La technique, appelée forme α, fournit une méthode efficace pour résoudre les conflits d'objectifs entre plusieurs robots qui peuvent vouloir visiter la même zone au cours de missions, y compris la recherche et le sauvetage sans pilote, la reconnaissance robotique, la surveillance du périmètre et la détection robotique de phénomènes physiques, tels que les radiations. et concentration sous-marine de formes de vie.

Des chercheurs du US Army Combat Capabilities Development Command, connu sous le nom de DEVCOM, du Laboratoire de recherche de l'armée et de l'Université du Nebraska, Département d'informatique d'Omaha ont collaboré, ce qui a conduit à un article publié dans la revue Robotics and Autonomous Systems de ScienceDirect.

«Les robots travaillant en équipe ont besoin d'une méthode pour s'assurer qu'ils ne dupliquent pas leurs efforts», a déclaré le chercheur de l'armée, le Dr Bradley Woosley. «Lorsque tous les robots peuvent communiquer, de nombreuses techniques peuvent être utilisées; Cependant, dans les environnements où les robots ne peuvent pas communiquer largement en raison de la nécessité de rester cachés, de l'encombrement conduisant à des radios qui ne fonctionnent pas pour les communications longue distance, ou pour préserver la batterie ou la bande passante pour des messages plus importants, les robots auront besoin d'une méthode pour se coordonner avec aussi peu. communications que possible. »

Cette coordination est accomplie en partageant leur prochaine tâche avec l'équipe, et certains membres de l'équipe se souviendront de ces informations, permettant à d'autres robots de demander si un autre robot effectuera cette tâche sans avoir besoin de communiquer directement avec le robot qui a sélectionné la tâche, a déclaré Woosley. .

Le robot qui se souvient d'une tâche est basé sur la topologie de leur réseau de communication sans fil et la disposition géométrique des robots, a-t-il déclaré. Chaque robot se voit attribuer une forme de délimitation représentant la zone de l'environnement pour laquelle il met en cache les emplacements des objectifs, ce qui permet une recherche rapide dans le réseau de communication pour trouver le robot qui saurait s'il y avait des objectifs demandés dans cette zone.

«Cette recherche permet la coordination entre les robots lorsque chaque robot est habilité à prendre des décisions sur ses prochaines tâches sans qu'il soit obligé de s'enregistrer d'abord avec le reste de l'équipe», a déclaré Woosley. «Permettre aux robots de progresser vers ce que ressentent les robots est la prochaine étape la plus importante lors de la gestion des conflits entre deux robots lorsqu'ils sont découverts lorsque les robots se déplacent entre eux et hors de portée de communication.»

La technique utilise une approximation géométrique appelée forme α pour regrouper des régions de l'environnement qu'un robot peut communiquer avec d'autres robots en utilisant des communications multi-sauts sur un réseau de communication. Cette technique est intégrée à un algorithme de recherche intelligent sur l’arbre de communication des robots pour trouver les conflits et les stocker même si le robot qui sélectionne l’objectif se déconnecte de l’arbre de communication avant d’atteindre l’objectif.

L'équipe a rapporté des résultats expérimentaux sur des robots simulés dans plusieurs environnements et des robots physiques Clearpath Jackal.

«À notre connaissance, ce travail est l'une des premières tentatives d'intégration de la prédiction basée sur la géométrie des régions de conflit potentiel pour améliorer la collecte d'informations multi-robot sous des contraintes de communication, tout en gérant gracieusement la perte de connectivité intermittente entre les robots», a déclaré Woosley.

Selon Woosley, les autres approches disponibles ne peuvent obtenir des informations que des robots qui se trouvent à l'intérieur du même réseau de communication, ce qui est moins efficace lorsque les robots peuvent entrer et sortir de la portée de communication avec l'équipe.

En revanche, a-t-il dit, cette recherche fournit un mécanisme permettant au robot de trouver rapidement des conflits potentiels entre son objectif et l'objectif qu'un autre robot a sélectionné, mais qui n'est plus dans le réseau de communication.

Ce qui rend spécifiquement cette recherche unique comprend:

    -Fournir une méthode efficace (rapide et avec peu de messages) pour résoudre les conflits d'objectifs entre plusieurs robots qui est robuste à la perte de communication intermittente et aux robots rejoignant ou quittant des ensembles locaux de robots qui sont en communication les uns avec les autres

    -Exécution aussi bonne que d'interroger chaque robot dans la plage de communication tout en économisant de la bande passante radio pour les communications plus importantes

    -Performant mieux que chaque robot fonctionnant entièrement seul sans communication

Woosley a déclaré qu'il était optimiste que cette recherche ouvrira la voie à d'autres méthodes de coopération limitée en matière de communications qui seront utiles lorsque des robots sont déployés dans une mission qui nécessite des communications secrètes.

Lui et l'équipe de recherche, y compris les chercheurs de DEVCOM ARL Dr John Rogers et Jeffrey Twigg et le chercheur du Naval Research Laboratory, le Dr Prithviraj Dasgupta, continueront à travailler sur la collaboration entre les membres de l'équipe robotique grâce à des communications limitées, en particulier dans le sens de la prédiction des autres robots. actions afin d'éviter les tâches conflictuelles au départ.

###

Des chercheurs du US Army Combat Capabilities Development Command, connu sous le nom de DEVCOM, du Laboratoire de recherche de l'armée et de l'Université du Nebraska, Département d'informatique d'Omaha ont collaboré, ce qui a conduit à un article publié dans la revue Robotics and Autonomous Systems de ScienceDirect.

Source: https://bioengineer.org/army-technique-enhances-robot-battlefield-operations/

Continue Reading

Bio-ingénieur

Dean Sam H Noh nommé boursier ACM 2020

Crédit: UNIST Sam H. Noh, professeur de génie électrique et informatique et doyen de la Graduate School of Artificial Intelligence…

Published

on

Sam H Noh, professeur de génie électrique et informatique et doyen de l'École supérieure d'intelligence artificielle de l'UNIST, a été élu membre 2020 de l'Association for Computing Machinery (ACM), la plus grande société scientifique et éducative au monde pour les professionnels de l'informatique. .

Le programme ACM Fellows récompense les 1% des membres les plus performants de l'ACM pour leurs réalisations exceptionnelles dans le domaine de l'informatique et des technologies de l'information et / ou pour leurs services exceptionnels à ACM et à la communauté informatique dans son ensemble. Les boursiers sont nommés par leurs pairs, et les candidatures sont examinées par un comité de sélection distingué.

Parmi les 95 professionnels nommés dans la cohorte 2020, le professeur Noh était le seul scientifique affilié à une université coréenne. À ce jour, seuls quatre scientifiques affiliés à des universités coréennes, dont le professeur Noh, ont été élus boursiers ACM.

Les 95 boursiers ACM sélectionnés cette année parmi les plus grandes universités, entreprises et laboratoires de recherche du monde ont réalisé des progrès dans des domaines tels que l'intelligence artificielle, le cloud computing, l'infographie, la biologie computationnelle, la science des données, l'interaction homme-machine, le génie logiciel, l'informatique théorique. , et la réalité virtuelle, a déclaré l'ACM.

Comme l'a noté le président de l'ACM, Gabriele Kotsis, «Les boursiers ACM 2020 ont fait preuve d'excellence dans de nombreuses disciplines de l'informatique. Ces hommes et ces femmes ont apporté des contributions essentielles aux technologies qui transforment des industries entières, ainsi que nos vies personnelles. » Elle a ajouté: «Nous nous attendons à ce que ces nouveaux boursiers ACM continuent à être à l'avant-garde dans leurs domaines respectifs.»

Le professeur Sam H. Noh est un éminent scientifique dans le domaine des logiciels système et des technologies de stockage de données. En plus d'avoir été nommé rédacteur en chef de ACM Transaction of Storage (ToS) en 2016, il a grandement contribué à la vitalité académique du domaine informatique. En 2017, il a été honoré en tant que membre distingué de l'ACM en reconnaissance de ses contributions à l'avancement du domaine de l'informatique. Le professeur Noh a également attiré l’attention internationale en février 2020, alors qu’il était l’un des deux coprésidents de la 18e conférence USENIX sur les technologies de fichiers et de stockage de l’USENIX (FAST ’20).

Le professeur Noh a reçu le B.S. diplôme en génie informatique de l'Université nationale de Séoul et du doctorat. diplôme en informatique de l'Université du Maryland. Il a rejoint le Département de génie électrique et informatique de l'UNIST en 2015. Avant de rejoindre l'UNIST, le professeur Noh a travaillé à l'Université George Washington et à l'Université Hongik pendant les 22 dernières années. Il est actuellement doyen de l'École supérieure d'intelligence artificielle à l'UNIST. Ses intérêts de recherche comprennent les problèmes de système d'exploitation liés aux systèmes embarqués / informatiques avec un accent sur l'utilisation de nouvelles technologies de mémoire, comme la mémoire flash et la mémoire persistante.

###

Source: https://bioengineer.org/dean-sam-h-noh-named-2020-acm-fellow/

Continue Reading

Bio-ingénieur

Horticulture Research accueille le Dr Steven van Nocker en tant que rédacteur en chef

Crédit: Michigan State University Horticulture Research a le plaisir d'annoncer la nomination du Dr Steven van Nocker comme responsable de la revue…

Published

on

Horticulture Research a le plaisir d'annoncer la nomination du Dr Steven van Nocker en tant que rédacteur en chef de la revue à partir de 2021.

Le Dr Steven van Nocker, professeur au Département d'horticulture de la Michigan State University, États-Unis, a obtenu un B.S. en biologie et génétique de l'Université Cornell, États-Unis et un doctorat. en biologie cellulaire et moléculaire de l'Université du Wisconsin, États-Unis. Ses recherches portent sur la génétique du développement des caractères importants pour la production des cultures horticoles, y compris la floraison, ainsi que sur la régulation de l'expression des gènes au cours du développement. Cette formation universitaire et cette expérience de recherche dans le domaine de l'horticulture et de la biologie moléculaire sont bien adaptées aux besoins éditoriaux actuels et futurs de la recherche en horticulture. Le Dr van Nocker a été l'un des premiers rédacteurs associés et a joué un rôle important dans le développement de la recherche en horticulture en tant que principale revue internationale en horticulture, en phytologie et en génétique. À ce jour, il a traité plus de 60 manuscrits en tant que rédacteur associé et a participé à la révision de nombreux autres manuscrits.

«Steve a gracieusement accepté mon invitation et j'apprécie énormément sa volonté d'accepter ce nouveau rôle et de relever le défi.» a déclaré le professeur Max Cheng, rédacteur en chef de Horticulture Research. «La recherche axée sur les plantes d'importance horticole offre des possibilités presque illimitées pour aborder des questions de longue date, intéressantes et fondamentales en biologie végétale», a commenté le Dr van Nocker. «Les nouvelles connaissances et découvertes pratiques trouveront une application immédiate aux problèmes liés à l'alimentation, à l'environnement, à la santé humaine et à la nutrition. La recherche en horticulture a un rôle essentiel à jouer pour mettre en évidence les plus importants d’entre eux, et je suis très heureux de cette opportunité de participer. »

###

Source: https://bioengineer.org/horticulture-research-welcomes-dr-steven-van-nocker-as-the-executive-editor/

Continue Reading

Trending